Попри всі новації та новели запропонованого кодексу є ще зворотній бік медалі. Існують міжнародні документи ратифіковані Україною, що достеменно регламентують дії обвинувачуваного у кримінальному процесі та взагалі усю процедуру дій, що стосуються кримінального дізнання. У проекті нового КПК цими положеннями знехтувано.
Деякі норми проекту кримінально-процесуального кодексу суперечать Конституції України, а також вибудувані таким чином, що зокрема, прокуратура ставиться у домінуюче становище перед іншими учасниками процесу.